Au cours de ses 15 années de carrière, elle a travaillé pour de nombreuses institutions de développement panafricaines et internationales, notamment le Groupe de la Banque africaine de développement, UNITLIFE (une initiative du United Nations Capital Development Fund), la Banque européenne pour la reconstruction et le développement, l’Initiative pour les médias africains et The ONE Campaign.
Elisa Desbordes-Cissé est titulaire d’un Master en Sciences politiques et Management interculturel de l’Institut d’études politiques d’Aix-en-Provence, en France. Elle est de nationalité française.